CHIP是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种方法，通过将染色质随机打断成一定长度的片段，通过免疫的方法沉淀蛋白质-DNA复合体，再将DNA纯化，电泳鉴定即可得到待测蛋白是否与DNNA相结合。通常用于研究某转录因子是否与某基因的启动子区结合，以探讨基因表达调控规律，对于深入研究肿瘤及心血管等疾病的发病机制具有重要意义。此外，CHIP还可以用于研究组蛋白的共价修饰与基因表达的关系。